1　/install/index.phpは，警告に従い削除します。

2　.data/config/config.phpをダウンロードしておきましょう。

このファイルは，アップロード時には存在しませんでしたが，インストール時に生成されます。
EC-CUBEを動かす為の重要な記述があります。
たとえば，運用途中でSSLを利用したくなった場合など，このファイルで変更します。
また，再インストールが必要な事態になったときには，データベースのバックアップの復元とともに，このファイルのアップロードが重要なカギとなります。